「臺．博．物．語」四個字分開的書名，代表的是一個關於臺灣與土地歷史、博物館與博物、物件與意義、言說與知識的故事。本書時間鋪陳橫跨荷蘭時代到清末，空間佈局廣達半個地球，連結日本、亞洲與荷蘭的歷史。敘事由「大員鳥瞰圖」臺博摹本的來歷為始，直到牡丹社事件為止。
透過「物件」指認「博物館」塵封「意義」的殘餘，如剝洋蔥，一層層深掘與剝示蘊藏於時代背後的轉型圖像，從容揭示原本隱晦地流佈於歷史底層的「時代精神」。隨意的敘事路徑撿拾拼湊有關「臺灣」早期歷史與「博物」知識的片段，再現一條重新認識臺灣史，既趣味又新奇的小徑。一連串起，作者帶我們目睹了不斷經歷啟蒙與蛻變的「臺灣故事」。
序 言 逡巡，在博物館的空間與時間
第一章 荷蘭人的「開臺」 8
一 地圖的機密 10
二 西班牙人的來路 14
三 荷蘭人的雙子城 20
四 VOC與福爾摩沙 28
第二章 異質時空的相遇 34
一 地圖的誘惑 36
二 外科醫師 44
三 新港文書 48
四 權力的表徵 57
第三章 國姓爺的世界 62
一 圖像與歷史 64
二 海寇與英雄 67
三 帝國朝貢圈外 70
四 「國性爺合戰」 76
五 漢布魯克英雄史詩 79
第四章 明治日本的出草 82
一 集體合照之謎 84
二 武士的最後出路 87
三 戰爭圖像與物件想像 97
第五章 牡丹少女事件簿 106
一 1874年寫真的出土 108
二 少女的命運 111
三 東京日日 114
四 另一種文化戰爭 117
第六章 本草與博物 124
一 「山貓皮骨」
二 栗田萬次郎蕃地行 132
三 「臺灣蕃地草木壓葉」 136
四 代結語 141
附註 146
