生物信息學

序一
序二
前言
第一章 概論
1.1 生物信息學產業的背景
1.2 人類基因組計划
1.3 什麽是生物信息學
1.4 生物信息學的研究目標和內容
1.5 生物信息學的發展
1.6 生物信息學研究方法的新進展
1.7 國內外對生物信息學研究現狀
1.8 生物信息學的主要意義和展望
1.9 生物信息學與生物實驗的關系
主要參考文獻
第二章 生物學基礎
2.1 生物學基礎
2.1.1 生命起源的三個階段
2.1.2 生命起源的假說
2.1.3 生命起源物質組成的爭論
2.2 生物的分類
2.3 核酸
2.3.1 核酸的化學組成
2.3.2 DNA的一級結構
2.3.3 DNA的二級結構
2.3.4 DNA的三級結構
2.3.5 生物體中的DNA
2.3.6 DNA的結構
2.3.7 核酸的變性、復性與雜交
2.4 蛋白質
2.4.1 蛋白質的組成
2.4.2 蛋白質的分子結構
2.4.3 蛋白質結構預測和分子設計
2.5 染色體和基因
2.5.1 染色體和染色質
2.5.2 基因及真核生物基因組
2.6 中心法則
2.6.1 中心法則的內容
2.6.2 DNA的復制
2.7 基因工程技術簡介
2.7.1 概論
2.7.2 基因克隆的技術路線
2.7.3 基因組文庫
2.7.4 重組DNA技術在醫學生物學中的應用
主要參考文獻
第三章 生物信息數據庫及其信息檢索
3.1 生物信息數據庫的類型
3.2 序列數據庫
3.2.1 核酸序列數據庫
3.2.2 蛋白質序列數據庫
3.3 結構數據庫
3.3.1 蛋白質結構數據庫
3.3.2 數據庫結構顯示秩序
3.4 生物數據庫的信息檢索
3.4.1 Retrieve服務器
3.4.2 數據庫結構顯示程序
3.4.3 SRS檢索工具
3.5 向數據庫提交數據
主要參考文獻
第四章 序列比對與算法
4.1 序列兩兩比對
4.2 多序列比對
4.2.1 多序列比對程序CLUSTALW
4.2.2 tree-based算法和iterative算法
4.2.3 中心算法
4.3 序列分析算法
4.3.1 動態規划算法
4.3.2 隱馬爾可夫模型
4.3.3 人工神經網絡
4.3.4 基因表達調控網絡
4.4 分子進化：系統樹發育分析
4.4.1 分子鍾與中性理論
4.4.2 進化樹
4.4.3 進化樹的分析步驟
4.4.4 相關軟件使用簡介
主要參考文獻
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21世紀是生命科學、新材料技術、信息技術突飛猛進的發展時期。生物信息學作為跨越生命科學和信息科學兩大熱點領域的學科展現了它蓬勃的生命力。生物信息學是包括生物信息的獲取、處理、貯存、分發、分析與解釋的所有方面的一門學科，它綜合運用數學、計算機科學和生物學的各種工具，研究、了解大量的生物學意義，已成為整個科學發展的重要組成部分，特別是在「後基因組時代（post genome era）」，面對人類基因組計划所產生的龐大的分子生物學信息，生物信息學的重要性越來越突出，無疑將會為生命科學研究帶來革命性的變革。

生物信息學是一門理論概念與實踐應用並重的學科，在我國，生物信息學隨著人類基因組研究的展開才起步，但已顯露出蓬勃發展的勢頭，許多研究單位已經開始或准備開始從事這方面的研究工作。

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