《望色啟微》共3卷82論。其中第一、二卷60論,基本以勾、摘《靈》、《素》的望色部分,加敘加議,予以五色所自生認、“五色配髒”、“五色主病法”、“望色胃氣不死論”、“望色隨人論”等。第三卷則是整段摘抄《靈樞經》各論中的望色部分,後以“示吉曰”簡單評述。共22論,其中18論引自《靈樞經》各論原文,如“陰陽二十五人篇”、“衛氣篇”、“論勇篇”、“本髒篇”、“師傳篇”、“五閱五使篇”等。
這是第一次從望診的角度系統地條理《內經》中的有關內容,是中醫重要的一部望診專書,其後雖有汪宏的《望診遵經》,但已經比《望色啟微》的出現年代晚了200余年。
《望色啟微》之後還有《醫意商》和《傷寒翼》兩部分。《醫意商》包括20例不同的類案。從各論的題目上可以看出是作者以自己在臨床上的心得體會向讀者展示對中風、癆瘵、小兒頓咳、瘡瘍初起、酒病、少年富貴志樂生病、癥瘕積聚、鼓脹、血證等疾病的診斷、辨證與治療方法。難能可貴的是書中還記錄了早期在民間施行的刮痧法,如打痧、提痧法。此部分還記錄了對煙性、煙毒的本草治療。書中雖少有理論考據,但作者對某些疾病的病因病機、治療方法的經驗之談,使內容非常充實難得。