來自基因組的一些數學

在當前這個大數據時代，來自生物學的數據占有相當突出的份額。這里包括DNA和蛋白質序列數據、基因表達和調控網絡數據，等等。浩如煙海的生物醫學文獻也是一種數據。同來自其他領域的大數據不同，生物數據反映着幾十億年自然界中物競天擇、適者生存的演化過程，因而在隨機和復雜的表象之下，蘊含着深刻的內涵和結構。從大量數據中揭示生物學規律，是生物信息學、計算生物學、乃至整個生物學的任務。然而，這本書不是生物信息學或計算生物學的入門，而是演示如何用粗粒化和視像化的辦法考察實際生物數據、提出問題和尋求答案，這樣做的過程中會自然地導致一些數學、特別是離散數學問題。這里涉及的離散數學包括圖論、組合學和形式語言學的某些篇章。書中實例，多數來自作者本人與合作者近18年的研究工作。本書可以為大學高年級學生、研究生和青年教師拓寬思路起到一些啟發作用。